Fakultas Kedokteran Hewan-Universitas Udayana (FKH-UNud) merupakan salah satu fakultas yang awalnya masih tergabung dalam Fakultas Peternakan (FKHP) yang menandai lahirnya Universitas Udayana. Universitas Udayana resmi berdiri pada tanggal 17 Agustus 1962, dengan Surat Keputusan Menteri Pendidikan Tinggi dan Ilmu Pengetahuan Nomor 104, tanggal 9 Agustus 1962, dan selanjutnya dikuatkan dengan Surat Keputusan Presiden Republik Indonesia Nomor 18, 18 Januari 1963.

Pada awal berdirinya, Universitas Udayana didukung oleh empat fakultas, yaitu Fakultas Sastra (FS), Fakultas Kedokteran (FK), Fakultas Kedokteran Hewan dan Peternakan (FKHP), Fakultas Keguruan dan Ilmu Peternakan. Ilmu Pendidikan (FKIP). Saat itu FKHP Universitas Udayana hanya membina bidang Ilmu Peternakan saja, dan pada tahun 1978 dibentuk Jurusan Kedokteran Hewan yang baru. Setelah 5 tahun bersama FKHP, pada tahun 1983 fakultas ini berkembang menjadi Fakultas Peternakan dan Program Studi Kedokteran Hewan.

Berdasarkan Surat Keputusan Dirjen Dikti No. 8 DJ/Kep/1983 tanggal 12 Februari 1983 tentang Pembentukan Program Studi Kedokteran Hewan Universitas Udayana sebagai Program Studi Antar Fakultas yang dapat menyelenggarakan Program Sarjana (S1) dan berlaku sejak 1 Juli 1983. Selanjutnya atas kerja keras seluruh sivitas akademika dan dukungan dari berbagai pihak, Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 204/0/1997, tanggal 22 Agustus 1997, yang menyatakan bahwa ia mendirikan Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana.

Hingga saat ini Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana telah melaksanakan tiga program yaitu Sarjana Kedokteran Hewan, Program Profesi Dokter Hewan (PPDH), dan Magister Kedokteran Hewan. Program sarjana memakan waktu 4 tahun dengan 146 sks dan dilanjutkan dengan program Profesional selama 1,5 tahun dengan 40 sks.

Mahasiswa yang kuliah di FKH Unud berasal dari seluruh wilayah Indonesia termasuk mancanegara seperti Timor Leste dan Malaysia. Kuliah di FKH Unud memiliki keunggulan yaitu lokasi kampus di tengah kota Denpasar dengan akses yang mudah untuk menunjang, biaya kuliah yang murah, biaya hidup yang terjangkau bagi mahasiswa, dan kemudahan dalam mencari tempat tinggal/penginapan mahasiswa. Keunggulan akademik adalah semua program studi telah terakreditasi A menurut LAMPTKes, dengan materi studi unggulan di bidang sapi bali, babi bali dan anjing kintamani.